上海交通大學共有3個學科排名全國第一，分別為工商管理、生物醫(yī)學工程和臨床醫(yī)學3個學科。第一名學科數(shù)排名全國第5。管理科學與工程排名全國第6。

中國最好學科排名中，各個學科排名的對象是在該一級學科設有學術型研究生學位授權點的所有高校，發(fā)布的是在該學科排名前50%的高校。按照上榜次數(shù)統(tǒng)計，上海交通大學55個學科上榜，排名全國第6。

不同學科的學科點基數(shù)不同，因此競爭的激烈程度也不一樣。計算機科學與技術、工商管理等熱門學科，參加排名的高校在300個左右，而像天文學、大氣科學、石油與天然氣工程和特種醫(yī)學這樣的小眾學科，設置的高校數(shù)都不超過20個。為此，中國最好學科排名引入了百分位段的概念，在絕對數(shù)排名以外還給出了每個學科點在本學科所處的相對位置。根據(jù)計算，共有23所大學的57個學科點入選全國前1%學科。上海交通大學2個學科入選全國前1%，分別是工商管理和臨床醫(yī)學。

中國最好學科排名的指標體系由軟科開發(fā)的學科發(fā)展水平動態(tài)監(jiān)控系統(tǒng)內(nèi)嵌的30余項測量指標所組成，這些指標全部都是高校學科建設部門日常管理中密切關注的關鍵指標，代表了學科點對本學科稀缺資源的占有情況。

軟科將這30余項指標劃分為10余個指標維度分別計算得分，然后歸納為高端人才、科研項目、成果獲獎、學術論文、人才培養(yǎng)5個指標類別，最后匯總得到學科點的總分。數(shù)據(jù)全部來自第三方數(shù)據(jù)源，如教育部、科技部、國家自然科學基金委員會、國際和國內(nèi)文獻數(shù)據(jù)庫等，經(jīng)過軟科開發(fā)的規(guī)范化數(shù)據(jù)清洗和學科歸類流程處理后，統(tǒng)一得到各個學科點的各項指標數(shù)據(jù)。

為了對高校各個學科的水平和發(fā)展態(tài)勢進行分析，軟科于2015年開發(fā)了高校學科發(fā)展水平動態(tài)監(jiān)控系統(tǒng)。該系統(tǒng)使用30余項反映學科競爭力的關鍵指標，幫助高校了解本校每個學科每項指標在全國學科點中的排序情況，找到學科發(fā)展的優(yōu)勢和短板。許多學校在使用過程中，從學科管理的角度出發(fā)，建議除了提供分項指標的分析，最好還能針對學科的發(fā)展狀況給出一個概括性的結論。

與此同時，隨著國家“雙一流”建設的持續(xù)推進，一流學科的評價和遴選再次成為高教界和社會討論的熱點。在這些背景下，軟科于2016年底決定開發(fā)中國最好學科排名，排名的目的是用客觀數(shù)據(jù)為高校的學科建設提供參考，也為學生擇校和公眾了解高校的學科水平提供信息。